Hiperslana okolja s koncentracijo NaCl do nasičenosti poseljujejo raznoliki mikroorganizmi, ki spadajo v tri domene. Vsi se morajo spoprijeti z nizko vodno aktivnostjo okolja, obstajajo pa različne strategije za zagotavljanje osmotskega ravnovesja celične citoplazme z visoko slanostjo medija. Ena od možnosti, ki jo uporabljajo številne halofilne arheje in nekaj predstavnikov bakterij, je kopičenje soli, v glavnem KCl, in prilagajanje celotnega znotrajceličnega delovanje na prisotnosti molarnih koncentracij soli. Bolj razširjena možnost je sinteza in kopičenje organskih osmotskih molekul, tako imenovanih kompatibilnih topljencev. V članku podajamo pregled mehanizmov osmotske prilagoditve v številnih modelnih organizmih, vključno z nekaterimi, ki kopičijo KCl, kot sta arheja Halobacterium salinarum in bakterja Salinibacter ruber, Halomonas elongata kot predstavnik bakterij, ki sintetizirajo organske osmotske topljence, ter evkariontske mikroorganizme, vključno z enocelično zeleno algo Dunaliella salina, črno kvasovko Hortaea werneckii in bazidiomicetno Wallemia ichthyophaga, ki uporabljajo glicerol in druge kompatibilne topljence. Za pridobitev celostne slike prilagoditev na življenje v razmerah visokih koncentracij soli v mikrobnem svetu je podana tudi primerjava strategij pri navednih modelnih mikroorganizmih ter še nekaterih drugih halofilnih mikroorganizmov.
F.02 Pridobitev novih znanstvenih spoznanj
COBISS.SI-ID: 33787097Zunajcelični vezikli so novoodkriti nano-sporočevalci med celicami pri človeku, prisotni v velikem številu v vseh telesnih tekočinah. Zaradi svoje značilne sestave in lahke dostopnosti so trenutno najbolj zanimive tarče za razvoj novih biooznačevalcev, terapevtikov in terapevtskih tarč. Ključno za uspešen razvoj je prilagoditev priprave in shranjevanja krvne plazme za proučevanje zunajceličnih veziklov po usklajenih priporočilih. Kri namreč poleg zunajceličnih veziklov vsebuje tudi druge nanodelce s podobnimi lastnostmi, kot so lipoproteini, virusi in proteini, ki motijo kasnejšo analizo tarčnih veziklov. Poleg tega lahko način odvzema krvi, transport in priprava plazme povzroči nefiziološko sproščanje veziklov iz krvnih celic, kar vnaša dodatno napako pri analizi tarčnih veziklov. Na obstojnost tarčnih veziklov vpliva tudi način dolgoročnega shranjevanja. Vse našteto, in tudi trenutno neznani parametri, zahtevajo prilagojen način priprave in shranjevanja krvne plazme za proučevanje zunajceličnih veziklov. Z objavo priporočil glede zbiranja, rokovanja in hranjenja zunajceličnih veziklov iz krvne plazme, v so-avtorstvu s tujimi kolegi in s podporo svetovnega društva ISEV, smo prispevali k strokovnemu napredku na področju zbirk bioloških vzorcev krvne plazme za proučevanje zunajceličnih veziklov. Kvalitetne biološke zbirke pa bodo pomembno prispevale k izboljšanju standardizacije in ponovljivosti raziskav zunajceličnih veziklov.
F.17 Prenos obstoječih tehnologij, znanj, metod in postopkov v prakso
COBISS.SI-ID: 34444249Molekularni mehanizmi parkinsonove bolezni (PB) so že bili preiskovani na ravni različnih omik. Poiskali in preučili smo študije različnih omskih pristopov, objavljenih med novembrom 2005 in novembrom 2017, da bi opredelili glavne patološke poti razvoja PB. V pregled smo vključili 107 študij, ki so raziskovale različne omske ravni PB. Študije smo razvrstili v 13 skupin glede na omiko, s katero so se ukvarjale: genomika, transkriptomika, epigenomika, proteomika, ncRNomika, interaktomika, metabolomika, glikomika, lipidomika, fenomika, okoljska omika, farmakogenomika in integromika. Razpravljali smo o značilnostih študij z različnih omskih področij, kot so glavne ugotovitve, število preiskovancev, vrsta biološkega vzorca in metodologija. Ročno smo preverili signifikantne rezultate posameznih študij in poiskali prekrivajoče se signale, ki bi lahko služili kot potencilani označevalci za tveganje za razvoj PB. Takšni označevalci bi lahko pripomogli k razvoju tarčnih prognostičnih / diagnostičnih panelov za zgodnjo diagnozo in za napoved prognoze in hitrosti napredovanja bolezni. Ta pregledni članek predstavlja primer celovitega pristopa k odkrivanju molekularnih patoloških procesov kompleksnih bolezni. Raziskovalce spodbuja k strukturiranju in integraciji že znanih omskih podatkov v bolj uporabno in razumljivo obliko.
F.01 Pridobitev novih praktičnih znanj, informacij in veščin
COBISS.SI-ID: 4035720Čeprav je farmakogenomika (PGx) že dobro uveljavljena raziskovalna disciplina, se še vedno ne uporablja pri vsakdanji oskrbi bolnikov. Izobraževanje je ključni korak za uspešno uvedbo PGx v klinično prakso. Ponuditi moramo skupne, med-profesionalne pristope, ki spodbujajo učenje o PGx na mednarodni ravni. Še posebej pomembno je, da izobraževanje na področju PGx omogoča razvoj lastnih misli in idej, da bi lahko razumeli in izvajali to hitro razvijajoče se področje znanosti
F.03 Večja usposobljenost raziskovalno-razvojnega osebja
COBISS.SI-ID: 34419673Simpozij na temo zunajceličnih veziklov: Extracellular vesicles - mediators and biomarkers of pathology je potekal 5. decembra 2019 na Inštitutu za biokemijo UL MF. Simpozij so organizirale Metka Lenassi (predsedujoča), Katja Goričar in Marija Holcar. Na simpoziju so bili predstavljeni najnovejši izsledki s področja zunajceličnih veziklov, njihova vloga pri patogenezi ter vezikli kot biološki označevalci bolezni. Kot vabljeni predavatelj je na simpoziju sodeloval tudi prof. dr. Kenneth Witwer (Izvršni predsednik za znanost in konference pri svetovnem društvu za zunajcelične vezikle ISEV; Johns Hopkins University v ZDA), svoje rezultate pa so predstavili tudi številni slovenski raziskovalci. Simpozija se je udeležilo več kot 80 oseb iz različnih ustanov iz Slovenije in tujine, saj so zunajcelični vezikli zelo aktualna tema. Simpozij promovira sodelovanje med slovenskimi raziskovalci na področju in tujimi strokovnjaki, to pa je sprožilo ustanovitev mreže SiN-EV: Slovenian network for extracellular vesicles, ki bo še izboljšala komunikacijo med člani in promocijo njihovih dosežkov.
B.01 Organizator znanstvenega srečanja
COBISS.SI-ID: 302996480