Kampilobakterioza je najpogosteje prijavljena bakterijska bolezen v EU, ki se prenaša s hrano. Namen raziskave je bil primerjati PCR v realnem času (qPCR) in digitalni PCR (dPCR) za kvantifikacijo bakterij Campylobacter jejuni v vzorcih vratne kože brojlerjev iz klavne linije v perutninski klavnici ter klasično števno metodo z gojenjem po ISO 10272-2 standardu. Rezultati so pokazali, da je qPCR dobra metoda z zanesljivo mejo zaznavanja (rLOD) in mejo kvantifikacije (LOQ) v območju teoretičnih mej. Obe meji rLOD in LOQ pa sta bili nad kritično mejo za stopnjo kontaminacije s C. jejuni na koži piščancev po priporočilih EFSA, zato predlagamo spremembo postopka v pripravi vzorcev (manj redčenja) pred izolacijo DNA. Opazili smo močno in statistično značilno korelacijo med qPCR in dPCR. Obe metodi PCR sta se značilno ujemali s klasično števno metodo, vendar je bila korelacija zmerna. Metoda dPCR je izkazovala značilen odklon proti precenjevanju števila, verjetno zaradi relativno velikega števila lažno pozitivnih zadetkov. Linearno dinamično območje je bilo pri obeh metodah PCR primerljivo, a se je metoda qPCR glede rutinske uporabe izkazala za bolj primerno.
COBISS.SI-ID: 4280442
Ovrednotili smo učinkovitost alternativnih protibakterijskih snovi - izvlečkov stranskega proizvoda vinarstva - grozdnih tropin sorte Modri pinot (GSS), ter izolirane učinkovine resveratrol, na bakterije C. jejuni ter analizirali mehanizme bakterijske odpornosti z mutanti v tarčnih genih izlivnih črpalk (cmeB, cmeR, cmeF). Pokazali smo aktivnost efluksnih sistemov CmeABC v mehanizmu odpornosti proti GSS ter resveratrolu, poleg tega pa tudi zmanjšanje adhezivnosti kampilobaktrov na modelno površino polistirena in izbrane celične linije ob sub-inhibitornih koncentracijah izvlečka in resveratrola. Aktivnost in načini protibakterijskega delovanja naravnih snovi določajo mehanizme odpornosti kampilobaktrov, poznavanje obojega pa nadaljnje korake pri aplikaciji novih alternativnih in inovativnih postopkov pri nadzoru kontaminacije z bakterijami C. jejuni v živilski industriji.
COBISS.SI-ID: 4699768
Preverili smo protimikrobni učinek izvlečka plodov Euodia ruticarpa (EREE) in posameznih frakcij izvlečka (frakcija Q, evodiamin, rutekarpin) ter njihov vpliv na preprečevanje filmotvornosti referenčnega seva C. jejuni NCTC 11168 in njegovih mutantov cmeB ter luxS, na površini nerjavnega jekla. Vpliv testiranih učinkovin smo spremljali tudi na nivoju prisotnosti signalnih molekul AI-2. Pri preprečevanju adhezivnosti in filmotvornosti na nerjavnem jeklu sta bila najbolj učinkovita pripravka EREE in frakcija Q (z 41,7 % deležem evokarpina), ki sta vplivala tudi na koncentracijo AI-2 molekul, določenih z luminiscenco poročevalskega seva Vibrio harveyi BB170. Študija ponuja smernice nadaljnjih raziskav filmotvornosti ter pojava in širjenja odpornosti bakterij C. jejuni na obstoječa protimikrobna sredstva v iskanje novih alternativnih sredstev naravnega izvora.
COBISS.SI-ID: 4651384