Nadgradili smo že obstoječo spletno aplikacijo GoMapMan (COBISS.SI-ID 2966607), tako da sedaj poleg že obstoječih rastlin (navadni repnjakovec, krompir, paradižnik, riž in tobak) vsebuje tudi kakavovec. Povezave v sami aplikaciji omogočajo lažjo interpretacijo podatkov visoko zmogljivih tehnologij preko prenosa znanja med modelnimi rastlinami in poljščinami. Z nadgradnjo smo to omogočili tudi za kakavovec.
COBISS.SI-ID: 3869775
V objavljenem članku je predstavljena vzpostavitev sistema z virusom povzročenega genskega utišanja (VIGS), ki temelji na virusu tobačnega mozaika (TRV) pri divjih sorodnikih krompirja za funkcionalne študije interakcije krompirja in virusa. Presejalna analiza večjega števila divjih sorodnikov krompirja (različne vrste rodu Solanum in njihove klone) za njihovo dovzetnost za VIGS je bila opravljena z utišanjem PDS gena. Identificirali smo več odzivnih vrst in nadalje preizkusili občutljivost teh genotipov na krompirjev virus Y (PVY) seva NTN in N. Pri nekaterih vrstah smo opazili, da je prisotnost praznega TRV vektorja omejilo gibanje PVY. Fluorescenčno označeni PVYN-GFP je sistemsko okužil samo pet testiranih divjih sorodnikov krompirja. Na podlagi rezultatov smo izbrali Solanum venturii (VNT366-2) kot najprimernejši sistem za funkcionalno analizo genov, ki sodelujejo v interakciji krompirj-PVY. Sistem je bil preizkušen z utišanjem dveh različnih rastlinskih signalnih kinaz povezanih z imunskim odzivom, StWIPK in StMKK6. Utišanje StMKK6 je omogočilo hitrejše širjenje virusa po rastlini, medtem ko utišanje WIPK ni imelo nobenega vpliva na širjenje virusa. Sistem, ki uporablja S. venturii (VNT366-2) in PVYN-GFP se je izkazal kot primerna metoda za hitro in enostavno funkcionalno analizo genov, ki sodelujejo v interakciji krompirja in PVY.
COBISS.SI-ID: 3877967