V tej publikaciji smo objavili genom koloradskega hrošča. Kot člani konzorcija i5k smo sodelovali pri popravljanju genskih modelov in manualni anotaciji več genskih skupin, vključno s tistimi, ki so bile uporabljene kot tarčni geni v tej študiji; prispevali pa smo tudi lastne RNA-seq podatke. Še neobjavljena zaporedja in podatke o ekspresiji genov (RNA-seq) smo uporabili v fazah projekta, v katerih smo izbirali tarčne gene.
COBISS.SI-ID: 4626767
Razvili smo prostodostopno spletno aplikacijo quantGenius (http://quantgenius.nib.si), ki omogoča zanesljivo kvantifikacijo podatkov pridobljenih z metodo PCR v realnem času (qPCR). Aplikacija interaktivno vodi uporabnika skozi vse korake od vhodnih podatkov, skozi kontrolo kvalitete in kvantifikacijo. Pomembna posebnost aplikacije je integracija sistema za podporo odločanju, ki temelji na kontroli kvalitete v skladu z uveljavljenimi standardi in upošteva napake pri pipetiranju, učinkovitost pomnoževanja ter limite detekcije in kvantifikacije. Aplikacija bo omogočila pridobivanje zanesljivih rezultatov, kar je osnova za biološko-relevantno interpretacijo rezultatov. Skupaj z ustrezno načrtovano analizo qPCR smo quantGenius v tem projektu uporabili za kvantifikacijo izražanja tarčnih genov koloradskega hrošča.
COBISS.SI-ID: 4351055