Nalaganje ...
Projekti / Programi vir: ARIS

Uporaba proteomskih in aptamernih pristopov za študij interakcij gostitelj-mikroorganizem pri stafilokoknih in klostridijskih okužbah

Raziskovalna dejavnost

Koda Veda Področje Podpodročje
3.01.00  Medicina  Mikrobiologija in imunologija   

Koda Veda Področje
B230  Biomedicinske vede  Mikrobiologija, bakteriologija, virologija, mikologija 

Koda Veda Področje
3.01  Medicinske in zdravstvene vede  Temeljna medicina 
Ključne besede
Clostridium difficile, Staphylococcus aureus, aptamere, masna spektroskopija, virulenca
Vrednotenje (pravilnik)
vir: COBISS
Raziskovalci (20)
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  29489  dr. Mirjana Bistan Žist  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2013 
2.  11130  dr. Sašo Džeroski  Računalništvo in informatika  Raziskovalec  2013 - 2016 
3.  18801  dr. Marko Fonović  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2013 
4.  18284  dr. Katja Galeša  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2013 
5.  33406  dr. Nikolaja Janež  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2015 - 2016 
6.  22312  dr. Gregor Kosec  Biotehnologija  Raziskovalec  2013 - 2016 
7.  23483  dr. Enej Kuščer  Biotehnologija  Raziskovalec  2013 - 2016 
8.  24975  dr. Damjan Makuc  Kemija  Raziskovalec  2013 - 2015 
9.  21244  dr. Jan Mavri  Materiali  Raziskovalec  2014 
10.  35029  dr. Tina Mikuletič  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2014 
11.  13542  dr. Hrvoje Petković  Biotehnologija  Raziskovalec  2013 - 2014 
12.  10082  dr. Janez Plavec  Kemija  Raziskovalec  2013 - 2016 
13.  34212  dr. Jelena Rajković  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2014 - 2016 
14.  12278  dr. Maja Rupnik  Mikrobiologija in imunologija  Vodja  2013 - 2016 
15.  13301  dr. Franc Strle  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2013 - 2014 
16.  22575  dr. Primož Šket  Kemija  Raziskovalec  2016 
17.  25593  dr. Tina Šmuc  Metabolne in hormonske motnje  Raziskovalec  2013 
18.  07561  dr. Boris Turk  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2013 - 2016 
19.  37945  Jasmina Tušar  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2015 - 2016 
20.  37161  Tanja Vrabič  Mikrobiologija in imunologija  Raziskovalec  2014 - 2016 
Organizacije (4)
št. Evidenčna št. Razisk. organizacija Kraj Matična številka Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  2592  ACIES BIO, biotehnološke raziskave in razvoj, d.o.o.  Ljubljana  2226391 
2.  2990  Center odličnosti za integrirane pristope v kemiji in biologiji proteinov, Ljubljana  Ljubljana  3663388 
3.  2992  EN-FIST CENTER ODLIČNOSTI  Ljubljana  3664830 
4.  3030  Center odličnosti za biosenzoriko, instrumentacijo in procesno kontrolo  Ajdovščina  3660460 
Povzetek
Staphylococcus aureus in Clostridium difficile, ki spadata med najpomembnejše povzročitelje okužb pri človeku in predstavljata veliko finančno breme za zdravstveni sistem, bosta modelna organizma za študij lastnosti bakterij, ki lahko doprinesejo k povišani virulenci. Za visokovirulentne seve S. aureus bomo smatrali povzročitelje endokarditisa ter seve C. difficile, ki povzročajo pseudomembranozni kolitis ali težjo obliko kolitisa z zapleti. Za ugotavljanje razlik med izolati povezanimi s težjo in lažjo obliko bolezni bomo uporabljali različne metodološke pristope. Za primerjalne proteomske analize bomo uporabili masno spektroskopske analize. Tem metodam komplementarna bo NMR, s katero bomo ugotavljali ali so prisotne razlike zaradi posttranslacijskih modifikacij ter izvajali natančnejšo karakterizacijo izbranih dejavnikov virulence. Aptameri so in vitro izbrane nukleinske kisline, ki se vežejo na različne tarčne analite: od funkcionalnih skupin, manjših molekul (npr. amino kislin, proteinov) do celih organizmov (npr. bakterijske celice). V okviru tretjega metodološkega pristopa bomo razvili aptamere specifične za vsaj enega od obeh modelnih organizmov, ki bi potencialno lahko razlikovali tudi bolj in manj virulentne seve.
Pomen za razvoj znanosti
Rezultati projekta so prispevali k razumevanju virulence pri dveh za človeka pomembnih pomembnih patogenih bakterijah, Clostridium difficile in Staphylococcus aureus z vidika endemičnosti, kolonizacije in povzročanja bolezenskih znakov. Razultati učinka subinhibitornih koncentracij izbranih protimikrobnih učinkovin so pomembni, ker kažejo ne samo na pomen takšnih koncentracij pri selekciji rezistentnih sevov, pač pa tudi pri vplivu na izražanje dejavnikov virulence. Rezultati dela projekta, v katerem smo razvijali specifične aptamere, pa so prispevali k razvoju novih načinov detekcije spor C. difficile.
Pomen za razvoj Slovenije
Projekt je omogočil sodelovanje treh Centrov odličnosti ter majhnega podjetja in s tem združeval komplementarna znanja in tehnologije ter omogočal razvoj različnih naprednih področij na nacionalnem nivoju. V projektno skupino so bili vključeni mladi doktorji znanosti. Razvite so bile metode s potencialno uporabo za razvoj diagnostičnih testov (aptameri). Prav tako so bili številni člani projektne skupine aktivni pri prezentaciji (in organizaciji) rezultatov na mednarodnih in domačih znanstvenih in strokovnih srečanjih ter predstavitvah nestrokovni javnosti.
Najpomembnejši znanstveni rezultati Letno poročilo 2013, 2014, 2015, zaključno poročilo
Najpomembnejši družbeno–ekonomsko in kulturno relevantni rezultati Letno poročilo 2013, 2014, 2015, zaključno poročilo
Zgodovina ogledov
Priljubljeno