Projekti / Programi
Spremljanje somatskih mutacij genov odgovornih za nastanek melanoma in klinična prognoza bolezni
| Koda |
Veda |
Področje |
Podpodročje |
| 3.04.00 |
Medicina |
Onkologija |
|
| Koda |
Veda |
Področje |
| B200 |
Biomedicinske vede |
Citologija, onkologija, kancerologija |
| Koda |
Veda |
Področje |
| 3.02 |
Medicinske in zdravstvene vede |
Klinična medicina |
melanom, somatska mutacija, prognoza
Raziskovalci (14)
Organizacije (2)
Povzetek
Kožni melanom predstavlja manj kot 5% vseh kožnih rakov, vendar povzroči več kot 80% smrti povzročenih s kožnim rakom. Žal se melanom pojavlja tudi prej kot večina drugih rakov in je pogost že med 30 in 50 letom starosti, kjer je eden izmed glavnih povzročiteljev izgube aktivnih let.
Somatske mutacije v različnih regulatornih genih so odgovorne za iniciacijo, promocijo in progres melanoma. Eden izmed najzgodnejših in najverjetneje nujen dogodek v patogenzi melanoma je konstitutivna aktivacija RAS-RAF-MEK-ERK signalne poti. S tem dobijo melanociti za kancerogenezo nujno potrebno stalno proliferativno sposobnost. Naslednji nujen korak v nastanku melanoma je zaobiti proces staranja melanocitov, kar posledično vodi v izogibanje apoptozi melanocitov, ki je eden bistvenih mehanizmov proti nastanku raka. Glavno vlogo pri tem ima verjetno INK4A (p16)-CDK4-RB pot, ki se v normalnih razmerah aktivira kot odgovor na mutiran B-RAF gen. Dodatno vlogo pri uravnavanju mehanizmov, ki vodijo v apoptozo imata gena ARF in TP53, ki pa sta mutirana pri večini melanomov. Kasen dogodek pri napredovanju melanoma je prekomerna aktivacija PI3K-AKT signalne poti s pomočjo mutiranih genov kot so PTEN, C-KIT ,N-RAS ali drugi, s katero dobijo melanomske celice sposobnost metastaziranja.
Informacije o genetskih in epigenetskih spremembah primarnih melanomov in njihovih metastaz nam lahko služijo kot pomembni prognostični dejavniki ali pa kot molekularni napovedni dejavniki odgovora na terapijo in s tem možnost uporabe različnih tarčnih zdravil.
Namen naše študije je:
· Ugotoviti prisotnost mutacij v nekaterih genih, vključenih v obe signalni poti, ki sodelujeta pri nastanku melanoma (C-KIT, N-RAS, B-RAF, MEK, PI3K, AKT in MITF) ali njuni regulaciji (ATM in CCND1) v primarnih tumorjih in/ali metastazah v regionalnih bezgavkah pri bolnikih s sledenjem vsaj 3 leta po postavitvi diagnoze
· Primerjati rezultate analize genov s kliničnimi informacijami, ki jih uporablja TNM klasifikacija (debelina tumorja po Breslowu, ulceracija, mikro/makro metastaze v regionalnih bezgavkah)
· Primerjati pogostnost mutacij v primarnih tumorjih in/ali metastazah v regionalnih bezgavkah pri bolnikih z enako klinično prognozo in različnim potekom bolezni (bolniki s ponovitvijo bolezni proti bolniki brez ponovitve bolezni)
Za analizo bomo uporabili prospektivno melanomsko bazo podatkov Onkološkega inštituta Ljubljana. Primerjali bomo 5 različnih skupin bolnikov z melanomom zdravljenih v obdobju 2001-2007 in nato redno spremljanih na Onkološkem inštitutu:
1. 70-100 bolnikov z lokaliziranim melanomom (stadij I in II)
2. 70-100 bolnikov z klinično okultnimi metastazami v regionalnih bezgavkah (stadij IIIA)
3. 70-100 bolnikov z metahronim pojavom klinično ugotovljenih metastaz v regionalnih bezgavkah (stadij IIIB)
4. 50 bolnikov s sinhronim pojavom klinično ugotovljenih metastaz v regionalnih bezgavkah (stadij IIIB)
5. 40 bolnikov z metastazami v regionalnih bezgavkah in neznanim primarnim melanomom.
Iz tkiva vklopljenega v parafin bomo izolirali DNA ter nato določali mutacije v predlaganih genih z metodo alelne diskriminacije. Rezultate bomo potrdili z metodo direktnega sekveniranja. Dodatno bomo določali število kopij posameznega gena.
Klinične podatke (spol in starost bolnikov, patomorfolške značilnostih primarnega tumorja in regionalnih metastaz, preživetje brez bolezni in skupno preživetje) bomo dobili iz prospektivne melanomske baze podatkov Onkološkega inštituta Ljubljana za obdobje 2001-2007.
Krivulje preživetja bomo izračunali s pomočjo Kaplan-Meierjeve metode. S pomočjo univariatne in multivariatne analize z uporabo log-rank testa in Coxovega regresijskega modela bomo določili dejavnike povezane s skupnim preživetjem in le-tega primerjali med posameznimi skupinami bolnikov. Kvantitativne spremenljivke bomo primerjali s Studentovimali Wilcoxonovim testom, kategorične pa s Hi2 testom.
Pomen za razvoj znanosti
Klinični rezultati raziskovalnega projekta so potrdili in dodatno razložili heterogenost bolnikov z melanomom. Glede na naše rezultate je tumorsko breme ključno pri napredovanju bolezni. Pri majhnih metastazah v regionalnih bezgavkah je čas njihove odstrabitve bistven za prognozo bolezni. Tisti bolniki z takojšnjo limfadenektomijo imajo do 20% boljšo prognozo.Ti rezultati govorijo v prid teoriji o sekundarnem metastaziranju – iz regionalnih metastaz v sistemske. V molekularno biološkem delu smo trenutno prišli do točke, kjer metodološki problemi za enkrat še preprečujejo definitivne zaključke.
Pomen za razvoj Slovenije
Ugotovitev, da imajo bolniki z takojšnjo limfadenektomijo boljšo prognozo kot tisti z odloženo predstavlja pomemben dokaz zaradi katerega je prišlo do spremembe priporočil obravnave bolnikov z melanomom. Pri vseh bolnikih z melanomom debelejšim od 1 mm priporočamo biopsijo varovalne bezgavke in v primeru pozitivnega izvida takojšnjo limfadenktomijo in ne čakanja na odloženo limfadenektomijo v primeru pojava regionalnih metastaz. S tem je pozdravljenih približno 20% več bolnikov z melanomom z reionalnimi metastazami. Glede na to, da gre za bolnike v najbolj produktivnem življenskem obdobju (30-60 let) ima to velik pomen za celotno družbo.
Najpomembnejši znanstveni rezultati
Letno poročilo
2011,
2012,
2013,
zaključno poročilo,
celotno poročilo na dLib.si
Najpomembnejši družbeno–ekonomsko in kulturno relevantni rezultati
Letno poročilo
2011,
2012,
2013,
zaključno poročilo,
celotno poročilo na dLib.si
