Projekti / Programi
Regulatorna genomika: nastanek in evolucija kompleksnega transkripcijskega regulatornega omrežja pri vretenčarjih
| Koda |
Veda |
Področje |
Podpodročje |
| 1.03.00 |
Naravoslovje |
Biologija |
|
| Koda |
Veda |
Področje |
| 1.06 |
Naravoslovne vede |
Biologija |
Raziskovalci (6)
| št. |
Evidenčna št. |
Ime in priimek |
Razisk. področje |
Vloga |
Obdobje |
Štev. publikacijŠtev. publikacij |
| 1. |
26491 |
dr. Maruška Budič |
Biokemija in molekularna biologija |
Raziskovalec |
2011 - 2012 |
0 |
| 2. |
30876 |
dr. Janez Kokošar |
Biokemija in molekularna biologija |
Mladi raziskovalec |
2009 - 2012 |
0 |
| 3. |
07673 |
dr. Dušan Kordiš |
Biokemija in molekularna biologija |
Vodja |
2009 - 2012 |
0 |
| 4. |
25628 |
dr. Lidija Kovačič |
Biokemija in molekularna biologija |
Raziskovalec |
2009 |
0 |
| 5. |
00412 |
dr. Igor Križaj |
Biokemija in molekularna biologija |
Raziskovalec |
2009 - 2012 |
2 |
| 6. |
19649 |
dr. Marija Nika Lovšin |
Mikrobiologija in imunologija |
Raziskovalec |
2009 - 2012 |
0 |
Organizacije (2)
Pomen za razvoj znanosti
Rezultati raziskovalnega projekta so relevantni za številna pomembna vprašanja regulatorne genomike sesalcev in vretenčarjev in so naslednji: pojasnitev nastanka transkripcijskih represorjev pri vretenčarjih (zakaj, kdaj, kje in kako), njihove evolucije ter funkcionalne diverzifikacije in ekspanzije, ki je omogočila nov način regulacije transkripcije in je privedla do izjemne diverzifikacije regulatornega omrežja pri vretenčarjih. Filogenomska analiza transkripcijskih represorjev v najstarejših genomih sesalcev (Prototheria, Metatheria in bazalnih placentalnih nadredov (Afrotheria in Xenarthra)) je dokončno pojasnila njihov izvor in kompleksno evolucijo pri sesalcih. Nastanek in razvoj transkripcijskih represorjev je bil verjetno ključen za nastanek regulatornih in bioloških razlik, ki so specifične ne le za sesalce ampak tudi za amniote in bazalne kopenske vretenčarje. Pojasnili smo mehanizme nastanka regulatornega omrežja transkripcijskih represorjev pri kopenskih vretenčarjih, kako se je razvijalo in zakaj se je tako močno povečalo pri sesalcih. Določene značilnosti DNA vezavnih (ZNF) in efektorskih (SCAN in KRAB) domen so bile ključnega pomena za nastanek regulatornega omrežja in za izjemno povečanje kompleksnosti in števila transkripcijskih represorjev. Pojasnili smo vlogo in vpliv de novo eksonizacije SCAN dimerizacijske domene na nastanek in močno povečanje regulatornega omrežja transkripcijskih represorjev v genomih ključnih skupin kopenskih vretenčarjev. Rezultati projekta so pomembni za številna znanstvena področja: regulatorno genomiko, komparativno genomiko, filogenomiko, biologijo sesalcev in vretenčarjev ter za regulatorno in funkcionalno evolucijo.
Pomen za razvoj Slovenije
Naše raziskave na področju evolucijske genomike so omogočile uvajanje novih metod in tehnologij na področju genomske biologije, »in silico« biologije, bioinformatike in molekularne evolucije v slovensko raziskovalno sfero. Pridobivamo nova praktična znanja, informacije in veščine na področju evolucijske in komparativne genomike, virologije in proteomike. Posledica našega raziskovalnega dela je da Slovenija ne predstavlja bele lise na področju genomske biologije in evolucijske genomike. Novo pridobljeno originalno znanje predstavljamo v člankih v zelo uglednih znanstvenih revijah ter na zelo uglednih mednarodnih znanstvenih konferencah. Teoretična in praktična znanja iz področij genomike, proteomike in molekularne evolucije prenašamo študentom Univerze v Ljubljani. Zelo pomemben vidik teh raziskav je tudi vzgoja diplomantov in mladih raziskovalcev. Diplomanti in MR, katerim smo bili mentorji, so odšli v farmacevtsko industrijo (KRKA, LEK) ali pa na druge fakultete in raziskovalne institute, kjer lahko uporabljajo novo pridobljena teoretična in praktična znanja iz področja genomike. Dokaz za uspešnost in sodobnost naših raziskav na področju evolucijske genomike so objavljeni članki v zelo uglednih znanstvenih revijah, predavanja in vabljena predavanja na zelo uglednih mednarodnih znanstvenih konferencah ter citiranost naših raziskav. Za Slovenijo so genomske raziskave pomembne, saj doprinašajo k mednarodnemu ugledu slovenske znanosti, ki na tem področju nedvomno dosega svetovno raven. Posledica naših raziskav na področju genomske biologije je izboljšanje prepoznavnosti in znanstvene konkurenčnosti Slovenije v svetu. Projekt je bil harmoniziran z Resolucijo o nacionalnem raziskovalnem in razvojnem programu 2006-2010 in s prvo tematsko prioriteto javnega razpisa: Raziskovanje genomike in biotehnologije za zdravje, kakovost in varnost živil ter trajnostnega razvoja. Projekt se je ukvarjal z raziskavami transkripcijskih represorjev, in je v tem smislu del širših raziskovalnih aktivnosti na področju komparativne genomike pri vretenčarjih, ki jih izvajamo v sklopu raziskovalnega programa P1-0207, financiranega s strani ARRS.
Najpomembnejši znanstveni rezultati
Letno poročilo
2009,
2010,
2011,
zaključno poročilo,
celotno poročilo na dLib.si
Najpomembnejši družbeno–ekonomsko in kulturno relevantni rezultati
celotno poročilo na dLib.si
